作為歐洲傳統農牧業國家，愛從歷史上就極為重視畜牧業生產。1991年獨立后，愛政府從政策和資金等多方面對畜牧業加以扶持，相關產業得到較大發展。但受自身氣候條件、人口規模和市場容量等因素限制，愛畜牧業發展也面臨一定的局限。
一、基本概況
（一）主要養殖種類。愛畜牧業養殖動物種類主要有牛（肉食牛和奶牛）、豬、羊（綿羊和山羊）、馬、兔、雞和蜜蜂等。其中，奶牛是愛最重要的牲畜品種，不但為愛畜牧業總產值的主要構成部分，也是當地養殖戶的主要經濟來源。
（二）主要養殖數量。據愛統計局數據，截至2011年底，愛肉牛存欄量23.8萬頭，奶牛9.63萬頭；綿羊8.7萬只，山羊3669只；馬6500匹；豬36.6萬頭；兔子3379只；蜂巢2.2萬個；家禽203.3萬只。近年來，作為最主要畜牧品種的奶牛養殖數量持續下降，但受益于單只奶牛產奶量的提高（單只奶牛年產奶量從2007年的6484公斤增加到2012年的7377公斤），牛奶總產量維持了十年前的水平。
（三）肉產品市場供給情況。據愛統計局數據，2011年愛屠宰牲畜11.85萬噸，產肉8.06萬噸。其中牛肉1.22萬噸，豬肉5.02萬噸，羊肉600噸，禽肉1.75萬噸，兔肉等100頓。另外，愛全國牛奶產量693萬噸；雞蛋183.8萬枚；羊毛126噸；蜂蜜694噸。愛農業部報告顯示，愛牛奶供給率可達需求量的150-160%；豬肉供給可滿足市場需求的100%；牛肉供給可滿足市場需求的80-85%；禽肉可滿足市場需求的50-60%。
（四）畜牧養殖戶數量。目前，愛畜牧業養殖戶共計19613名。其中個體養殖戶共17886戶，法人養殖戶共1727戶。其中，奶牛養殖戶共3520名（個體養殖戶3201戶，法人養殖戶319戶）。
（五）畜牧業產值。2012年愛農林牧漁業總產值為8.86億歐元，同比增長11.7%，占GDP的3.76%。農業總產值中，種植業產值3.91億歐元，占比44%；養殖業產值4.07億歐元，占比46%；農業服務產值0.875億歐元，占比9.9%。養殖業中，牛奶產值最大，為2.06億歐元，其它依次為豬、牛、禽肉制品，產值分別是8937萬、5797萬和2427萬歐元。
（六）畜牧產品進出口情況。根據2011年愛進出口數據，當年愛進口活畜300噸，出口活畜1.74萬噸；進口各類肉6.8萬噸，出口肉制品3.91萬噸。其中，2011年進口牛肉7300噸，出口牛肉3400噸；進口豬肉3.32萬噸，出口豬肉2.19萬噸；進口禽肉2.22萬噸，出口禽肉1.09萬噸。
二、有關支持
（一）政策方面。1992年，愛實施《農業改革法案》，摒棄前蘇聯統治時期集體農莊模式，大力鼓勵私人牧場或畜牧有限公司發展模式。在法律政策扶持下，畜牧業養殖戶的積極性得到調動，產業得以較快發展。為配合歐盟的相關規定，愛于1995年通過《畜牧業養殖法案》，在養殖注冊、監管等領域進一步向歐盟標準靠攏。但在加入歐盟之前，受制于農業補貼力度太小，愛農產品在歐盟市場上無法與西歐國家產品競爭。2004年，愛加入歐盟，《歐盟共同農業政策》的采用及大額歐盟農業補貼對愛的畜牧業發展注入強心針。
（二）資金方面。愛獨立后，先是政府自身撥款，后又利用歐盟資金，大力對愛畜牧業進行直接資金補貼。2006年之前，每年補貼不超過100萬歐元。2007年之后，補貼額度首次超過140萬歐元，后逐年增加，2011年為164萬歐元。從1993年至2011年19年間，愛政府為畜牧業總補貼額度已超過1792萬歐元。另外，加入歐盟后，來自歐盟的補貼從2004年的200萬歐已經增加到2011年底的1億歐元。
（三）行業協會發揮重要作用。愛農業部負責畜牧養殖業的法律法規及政府補貼行政工作，下屬有負責管理全國畜牧業養殖的總協會，總協會下屬設有奶牛養殖戶協會、豬養殖戶協會和羊養殖戶協會等分支機構。協會由養殖戶自發設立，民主推選協會負責人。門類齊全功能全面的協會組織能保證眾多養殖戶及時與政府部門溝通，反映自身訴求，解決養殖過程中面臨的實際困難和難題。
三、遇到的困難
（一）農業從業人員日益減少。受出生率低和對外移民增加影響，愛總體人口規模持續下降。根據最新統計，截止2011年底愛全國人口僅128萬，較10年前下降6萬人，且減少趨勢依然明顯。隨著城市化進程不斷推進，年輕人為滿足工作需要或孩子的教育需求，大部分都已搬遷到塔林、塔爾圖和納爾瓦等較大城市生活工作，留在鄉村或小鎮從事農業和畜牧業的人口越來越少。
（二）難與西歐高額補貼相比。盡管愛獨立后，畜牧業補貼不斷提高，總補貼額度接近2000萬歐元，但這與西歐國家動輒數億甚至十幾億的農業補貼相比，劣勢明顯。據愛自己測算，愛農牧業得到的實際補貼僅為老歐洲成員國的四分之一到五分之一。在2012年12月歐盟于布魯塞爾召開會議之時，愛農民不但在國內舉行集會抗議，甚至威脅開著拖拉機到布魯塞爾抗議，顯示了國內對補貼過低的不滿。
（三）自身地理條件限制。愛國土面積4.5萬平方公里，東西長度約370公里，南北跨度約240公里，是歐盟內部國土面積最小的國家之一。農耕及畜牧土地儲量有限。另外，畜牧業養殖首先得考慮飼料的供應問題。愛地處歐洲東北角，北緯58度上下，冬季寒冷漫長，全年氣溫平均5.1攝氏度。適合植物生長的天數約為170-185天。也就是說，除了夏天可放牧外，其余時間牛、羊、馬等飼料只能靠夏季囤積飼料。
四、市場監管
（一）依賴商協會等民間組織。各養殖戶組織在農業部領導下，分工明確，各負其責。農業部下屬諸多獨立委員會和商協會，分別負責注冊、流通、加工、疾病防控和良種繁育等工作。各部門業務相互獨立，又相互配合。其中，愛農業部下屬農業注冊和信息局（ARIB）具體負責牛、羊、豬和馬的登記注冊。該局自2000年起強制登記所有養殖動物信息，且網上備案，方便及時查詢；畜牧動物的成長記錄主要由愛動物登記中心（ERAC）負責。該中心不但記錄動物成長經歷、患病和治療經過，也負責獨立監測牛奶質量；基因保護主要由愛生物中心（CBD）負責。該中心同時負責保護愛生物多樣性和良種繁育。
（二）依賴法治和網絡互連提升監管力度。除了依據食品法等嚴格打擊不良食品業商人外，為控制動物疫情傳播及追蹤有害食品來源，愛國內建立了動物登記注冊系統，并加入了北歐和波海地區動物查詢系統。不管是采購商、用戶還是政府監管部門，一旦有任何疑問，可隨時對畜牧產品的來源、成長史、疾病史和加工地等進行了解。
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