囊謙縣位于青海省最南端,玉樹州東南部,與西藏昌都地區接壤,東西最長157.5公里,南北最寬130.5公里,總面積12741平方公里。其中耕地面積14.3832萬畝,有可利用草場1663萬畝,林地422萬畝。1999年末,全縣總人口54703人,其中純牧業人口31017人,半農半牧人口20022人,城鎮人口3664人,主要民族有藏族、漢族、回族、土族等,其中藏族人口占總人口的97%以上。縣人民政府駐地香達距州府結古165公里,距省會西寧965公里。全縣公路通車里程1331公里。囊謙縣下轄香達、白扎、覺拉、吉曲、吉尼賽、娘拉、毛莊七個半農半牧鄉和尕羊、東壩、差曉三個純牧業鄉,共69個村(牧)委會,291個村(牧)民小組。
囊謙縣除充裕的大氣降水外,還有豐富的地表河流水,均屬瀾滄江水系。扎曲、孜曲、巴曲、熱曲、吉曲五條大河由西北平行向東南貫穿全境,流經長度為599公里,年平均流量387.6立方米每秒,年平均經流量為113.27億立方米。水能理論蘊藏量142.59萬千瓦,平均每平方公里儲能112千瓦。全縣自產人均水量為6.55萬立方米,為世界人均水量的7.4倍,為我國人均水量的24倍。
全縣79.88萬畝林業用地中,有用材林13.89萬畝、防護林2.1萬畝、疏林地14.67萬畝、灌木林46.78萬畝、無林地2.45萬畝。現有木材蓄積量為208.78萬立方米,其中云衫179.53萬立方米,圓柏32.05萬立方米,樺木0.2萬立方米。全縣森林覆蓋率7.8%。
1994年初,共有各類牲畜65.28萬頭(只),其中牦牛28.58萬頭,綿羊19.27萬只,山羊15.64萬只,馬屬動物1.79萬匹。牦牛數量居全縣牲畜之首,是由野牛馴化站培育而成的,屬青藏高原特有的牛種,也是稀有家畜品種;藏系綿羊數量居第二位,屬藏系粗毛羊,體質粗糙緊湊,適應性強,晚熟,生產性能較低,是適應高寒環境的綿羊品種;山羊占全縣牲畜總數的第三位,適應陡峭的高崇山峽谷和森林灌叢環境,屬克什米爾紫絨山羊中的原始品種。此外,尚有馬、黃牛、驢(騾)、雞等品種。