為了吸引外資，日本各地方政府根據相關條例和制度，單獨制訂了一些優惠政策，通過減免事業稅、減免房地產購置稅等稅收優惠、發放補貼、提供土地和建筑、融資貸款制度等各種措施鼓勵投資。詳細情況參見日本貿易振興機構網頁中專門網址www.jetro.go.jp/invest/region/，查閱日本各地招商引資的相關產業、優惠政策、及具體窗口部門。
日本政府對吸引外資越來越重視，各有關主管部門都設置了對招商引資的綜合窗口及相關政策，請參照日本內閣府“投資日本“的網頁www.invest-japan.go.jp/link/index.htmal中的各政府部門相關鏈接，了解日本政府相關部門協助招商引資的具體政策。
2011年，東日本大地震后，日本緊急出臺《東日本大地震復興特別區域法》，根據該法巖手、宮城、福島三縣全境和北海道、青森、茨城、櫪木、埼玉、千葉、新瀉、長野等道、縣局部區域被指定為復興特區，可制定和享受系列優惠待遇，致力于產業復興和地區經濟復蘇，各道、縣的優惠政策主要包括稅收優惠、就業和購進設備補貼等內容，因各地產業不同，優惠政策不盡相同，有興趣的企業可通過日本貿易振興機構網頁中對日投資信息下，地域進出支援NABI頁面瀏覽各都道府縣鏈接獲取相關信息。
比較有代表性的地區及相關政策特點，請參見如下個例。
關東地區：
【神奈川縣】優惠政策主要包括：
（1）稅額扣除：削減固定資產稅、事業所稅、房地產稅。
（2）補貼：辦公地租賃費的補助（補助租賃費等方式）。
（3）貸款：低息融資等。
關西地區：
【大阪府】大阪府是日本第二大城市，有四家投資促進機構，其中，大阪外國企業招商中心（O-BIC）和大阪市投資促進中心（IBPC）具備外語服務（含中文）機能，對于首次來日本投資的外國企業會更容易溝通。
（1）融資優惠：企業在大阪府規定的區域內（大致分布在茨木市、泉佐野市、枚方市等8個指定區域）投資，并向大阪府企業招商促進中心申請得到認可后，即可獲得大阪府給予的融資優惠。具體內容為：①融資優惠對象：設備資金（如購買土地、建筑物、設備等）和周轉資金（租賃設備）。②融資額度：設備資金最多可貸10億日元，周轉資金最多可貸5000萬日元（但兩項合計不能超過10億日元）。③貸款利率：1.6%（根據具體金融形勢會有所浮動）。④貸款期限：設備資金貸款期最長為15年（寬限期2年），周轉資金貸款期最長為7年（寬限期1年）。
（2）稅收優惠：在大阪府規定的兩大產業集群區域內投資的企業可獲得不動產購置稅減半的優惠（上限為2億日元）。第一產業集群區域主要分布在大阪府西南部鄰近關西國際機場的沿海地區，第二產業集群區域主要分布在大阪府東部的八尾市。
（3）補貼優惠：補貼優惠分為投資促進補貼和尖端產業補貼兩部分。投資促進補貼主要針對有意進行新建或改擴建廠房及建立研發設施的企業而設立，補貼率為投資額的5%，上限為5千萬日元。此項優惠對企業的投資規模有較高的準入門檻，如中小企業投資額必須在1億日元以上，大企業投資額必須在5億日元以上。尖端產業補貼主要針對大阪府規定的重點尖端產業投資項目而設立，補貼額最多可達150億日元。此項優惠對企業項目涉及的領域和雇傭當地勞動者人數有嚴格要求，如投資領域必須在生物、生命科學、機器人、數碼家電、新能源等；雇用當地勞動者必須在10至100人以上（不同行業有不同要求）。
（4）其他優惠措施：大阪外國企業招商中心（O-BIC）針對在該機構登記的企業實施上限為50萬日元的手續費減免優惠；大阪市投資促進中心（IBPC）和日本貿易振興機構（JETRO）為有意投資的企業提供免費租借的辦公室（一般使用期限為2個月）。
【神戶市】神戶市近年來一直致力于構建日本國內最高水準的吸引外資體系，并以醫療產業為重點著力打造神戶市獨具特色的醫療產業城市形象。外國企業的投資項目只要落戶在神戶市劃定的三個區域內，就可以享受到相關優惠政策。這三個區域分別是：（A）海邊人工島2期、海邊人工島西北部、機場島；（B）HAT神戶商業區；（C）神戶科技園。
（1）融資優惠：①為幫助外國企業的投資項目盡快落地，神戶市可提供10億日元設備購置費的融資優惠，貸款利率1.75%（固定利率），貸款期最長可達20年（寬限期3年）。②神戶市可為企業提供相當于整體項目資金80%的融資優惠，上限為25億日元，貸款利率1.35%（固定利率），貸款期最長可達15年（寬限期2年）。這兩項優惠在三個區域全部適用。
（2）稅收優惠：①房地產購置稅減半（上限為2億日元）。②三年內固定資產稅和城市建設稅減半。以上兩項優惠在三個規定區域全部適用。③3年內企業所得稅減半。此項優惠適用于A、C兩個規定區域。
（3）補貼優惠：①雇傭當地人員在11人以上的新項目，可享受每人30萬日元的補貼，上限為3億日元。②引進新能源的項目可享受設備購置費的補貼，補貼率為50%，上限為3億日元。③尖端技術型項目的設備投資補貼（不含土地），補貼率為3%，不設上限。這三項優惠在三個規定區域全部適用。
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